Линиите за производство на модифицирано нишесте могат да обработват сурово царевично нишесте, нишесте от маниока и т.н., чрез методи на екструзия, за да променят първоначалните им физични или химични свойства в различна степен. Нишестето с променени свойства след вторична обработка се нарича общо модифицирано нишесте. За да се подобри производителността на нишестето и да се разшири обхватът му на приложение, се използват физични, химични или ензимни обработки за въвеждане на нови функционални групи в молекулите на нишестето или за промяна на размера на молекулите на нишестето и свойствата на гранулите на нишестето, като по този начин се променят естествените свойства на нишестето (като температура на желатиниране, термичен вискозитет и неговата стабилност, стабилност при замръзване-размразяване, желираща сила, филм-образуващи свойства, прозрачност и т.н.), за да стане по-подходящ за специфични изисквания на приложението.
Целите на модификацията са две: Първо, да се адаптира към изискванията на различни индустриални приложения. Например високо{1}}температурната технология (стерилизация на консерви) изисква нишесте с добра устойчивост на вискозитет при високи-температури; замразените храни изискват нишесте с добра стабилност при замразяване-размразяване; и желеобразните храни изискват добра прозрачност и свойства за-образуване на филм. Второ, да се изследват нови употреби на нишестето и да се разшири обхватът му на приложение.
Модифицираното нишесте е вид модифицирано нишесте, което е претърпяло определени обработки, за да промени първоначалните си физични или химични свойства в различна степен. Този тип нишесте притежава уникални физикохимични свойства, които, когато се добавят към хранителни формули, могат да подобрят ефективността на храната по време на обработка и консумация. Корекциите на екструзионната камера и шнековата структура диверсифицираха функциите на модифицираното нишесте, което доведе до серия от модифицирани нишестени продукти, подходящи за текстил, храни, производство на хартия, строителни материали, леене, нефтени сондажи и други области. С по-нататъшни изследвания екструдерите ще играят все по-важна роля на пазара на модифицирано нишесте.